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类器官模型国内外数据库近年文献研究热点分析
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摘要:0 引言 Introduction 类器官是指干细胞在体外3D 培养条件下,分裂分化形成“类似”器官的生物结构,可重现对应器官的功能,提供一个高度相似的生理系统[1]。类器官技术发展近年来在国
0 引言 Introduction
类器官是指干细胞在体外3D 培养条件下,分裂分化形成“类似”器官的生物结构,可重现对应器官的功能,提供一个高度相似的生理系统[1]。类器官技术发展近年来在国际上逐渐受到重视,2017 年《Nature》杂志评选类器官技术为年度最佳生物技术。
2018 年5 月,《Nature》杂志发表了类器官技术在癌症研究中的重要应用,发现与多种临床前模型比较,类器官具有明显优势[2]。2018 年《Science》杂志报道了首个肠癌类器官药敏临床疗效观察试验,并获得了88%的阳性预测值和100%的阴性预测值的结果[3],首次证明患者来源的类器官可预测抗癌药物的有效性,可能成为较好的临床前模型。2019年2 月,《新英格兰医学杂志》在线发表了类器官综述:类器官可作为最佳临床前模型[4],类器官作为新型疾病模型的特征在于,与2D 培养相比,其具有维持基因组稳定性,保持个体化异质性,重现本器官功能,可研究细胞间作用的特点;与动物模型相比,具有可操作性高,时效性经济性强,实现高通量研究,伦理风险低的特点;此外,类器官还具有分化增殖,自我更新,诱导进化,重现组织结构,实现生理功能的特性。在2019 年5 至6 月,《Nature》《Cell》及《Science》杂志分别发表了类器官特刊,以肯定类器官研究在生物医学领域的重要国际地位,因此构建类器官模型具有重要意义。目前类器官研究涉及到的主要热点领域包括干细胞和发育模型,肿瘤研究模型、个体化治疗模型和新药开发临床前模型等。
鉴于此,文章总结并分析了近10 年国内外数据库类器官模型文献,以期全面了解类器官研究的主要热点。
1 资料和方法 Data and methods
1.1 检索策略
1.1.1 检索者 第一作者。
1.1.2 检索数据库 万方数据库、Web of Science 数据库、中国临床试验注册中心、北美临床试验注册中心和SooPAT 中国专利数据库。
1.1.3 检索时间 截止至2020-05-14。
1.1.4 检索内容 与类器官相关的近10 年文献进行分析总结,检索策略见表1。
1.2 文献热点提取及分析方法
1.2.1 对万方数据库检索到的文献进行发表年及关键词的计量学分析 分析中国学者在类器官研究领域的研究进展及热点概述。并对经典中文文献从发表年、类器官模型、研究类型和研究领域进行分析总结。
1.2.2 对Web of Science 数据库(核心集)检索到的文献采用Histcite 软件进行计量学分析
(1)选取被引频次最高的20 篇文献生成可视化引文编年图,并对类器官同行学者评价最高的TOP10文章进行热点分析。
(2)HistCite 软件主要的功能是统计分析,其在引文网络的分析构建上架构清晰,可清楚发现引文网络中关键文献及大概发展[5]。
(3)文章采用的HistCite Pro 2.1 软件主要参数指标:总被引频次(global citation score,GCS),某一文献在整个Web of Science 数据库中的总被引用次数,引用者包括同行专家和非同行专家;本地被引频次(local citation score,LCS):某一文献在本地所检索的文献数据集中的被引用次数,引用者只包括同行专家。该文章主要分析GCS 指标排行较高的文章,以分析类器官研究热点。
1.2.3 对中国临床试验注册中心( 分析项目包括注册号、中文题目、机构、样本量、设计类型和首次注册时间,进一步分析对比2 个数据库中临床注册方案内容的差异。
1.2.4 对SooPAT(中国专利)数据库纳入的中国专利文章的类型、申请号、名称、类器官、用途、申请人和申请日进行分析 总结中国学者在类器官研究领域的专利技术进展。
表1 |各数据库文献检索策略(检索时间截止至2020-05-14)Table 1 |Literature retrieval strategies (the retrieval deadline was May 14, 2020)数据库 检索词 检索表达式 限定条件 纳入研究数量万方数据库 类器官 题名:“类器官” (1) 资源类型:会议、期刊、学位论文;(2) 检索时间范围:2009 至2020 年187 Web of Science 数据库(核心集) 题名:“Organoid*” 检索时间范围:2009 至2020 年 2 450中国临床试验注册中心 类器官 题名:“类器官” 检索时间范围:2009 至2020 年 13北美临床试验注册中心 题名:“Organoid” 检索时间范围:2009 至2020 年 23 SooPAT(中国专利)数据库 类器官 专利名:“类器官” 法律状态:有权专利国家:中国检索时间范围:2009 至2020 年55
2 结果 Results
2.1 基于万方数据库187 篇类器官研究文章的热点分析
2.1.1 万方数据库类器官研究文章在2019 年研究呈爆发持增长 从2009 至2019 年,中国万方数据库收录了类器官相关中文研究187篇,随年代逐渐增加,其中2019年文章最多为75篇,而2010 年文章最少仅1 篇,2020 年截止到2020-05-14 仅检索到12 篇。中国类器官研究起步较晚,从2015 及2016 年开始逐渐增多,2019 年类器官研究呈爆发式增长,说明了过去1 年中国学者在类器官相关领域中研究较为活跃。见图1。
文章来源:《实用肿瘤杂志》 网址: http://www.syzlzz.cn/qikandaodu/2021/0309/480.html